大約於西元1967年（民國56年），當時堂主王照義從台南南鯤鯓代天府請分靈，五府中三王吳府先到花蓮，其餘各府陸續迎請，起初供奉於家中，後聽從神明指示要於花蓮救世，大約西元1991年（民國80年）建廟完成。
南鯤鯓代天府主祀代天巡狩李、池、吳、朱、范千歲(俗稱五府千歲或鯤鯓王)，是臺灣歷史最久的五府千歲，相傳明朝末年，有王船漂流到南鯤鯓海邊沙汕，船內有李、池、吳、朱、范和中軍府等紙神像，漁民遂建草寮供奉，明朝永曆16年（公元1662年）時改建為廟。南鯤鯓沙汕被淹沒，歷經多次重建，在民國101年（公元2012年）新建凌霄寶殿落成，成今日巍峨廟況。
南鯤鯓代天府歷史悠久且分香廟遍及海內外，是全臺灣王爺信仰的大本營，有「王爺總廟」之稱。五府千歲進香期是全臺規模最大、進香團最多的王爺祭典，保存完整的進香儀式和各式陣頭活動，充分展現宗教文化的藝能特色。日治時期由名匠師王益順(公元1861年-1931年)主持的重修與擴建，延續傳統閩南建築的風格，在格局、木結構、雕刻、石作等各方面均極為精美，在建築史上被列為日治時期的廟宇代表作品之一。
南鯤鯓代天府是一座位於臺灣臺南市北門區之王爺廟，為台灣五府千歲的王爺總廟，主祀「代天巡狩」李、池、吳、朱、范 府千歲五府千歲。廟址在臺南市之西北方，位居槺榔山虎峰，俗稱南鯤鯓王爺廟（簡稱南鯤鯓廟、南廟）、南鯤鯓王爺宮，並與歸仁保西代天府、佳里金唐殿一同被稱為「南瀛古三大代天府」。也是台南面積最大廟宇。
建築之美
