五府千歲分靈超過二萬六千餘的臺灣王爺總廟

第一大殊榮，在1966年，中央研究院研究員劉萬枝最早提出南鯤鯓代天府為臺灣王爺總廟，並後來確立這一名號，成為臺灣王爺廟的代表廟宇之一。第二大殊榮，之謂南鯤鯓代天府為臺灣王爺總廟的原因之一，就在於分靈廟宇多達二萬六千餘間，信徒遍佈台灣。第三大殊榮，據交通部觀光局統計，南鯤鯓代天府年香客多達近千萬人次，香火鼎盛。

臺灣國家級重要古蹟 - 南鯤鯓代天府

第四大殊榮，1997年7月被國家認定升格為「國定古蹟」，認證南鯤鯓代天府超過300年來的歷史文化。第五大殊榮，南鯤鯓代天府王爺進香期在2014年在文化部中登錄為國家重要民俗，以顯宗教文化的傳承。第六大殊榮，南鯤鯓代天府是臺灣的十大廟會之一，盛況空前絕後。

南鯤鯓代天府不僅是宗教文化的傳承 更是米其林三星級旅遊景點

第七大殊榮，在2011年法國的《米其林綠色指南》以具傳統宗教文化、建築特色及周邊特殊環境生態景觀等優越條件，評鑑為最高級的「米其林三星景點」。第八大殊榮，在2012年「蕃薯藤輕旅行頻道」舉辦網友票選，以近8萬票獲選為臺灣新十二大景點。第九大殊榮，同2012年，在「十大陸客最值得拜訪宗教聖地」大PK中獲選第一名。第十大殊榮，南鯤鯓代天府藉宗教建築的特色與文化，列為臺灣十大廟宇建築。